本发明公开一种电子座便器的除垢装置、系统、及除垢方法，除垢装置包括：除垢液存储罐、容置固体除垢剂的除垢剂贮存盒、本体出液管、以及本体进液管，除垢液存储罐内设置有除垢剂空间，除垢剂贮存盒设置在除垢剂空间内，且除垢剂贮存盒的内部与除垢剂空间连通，除垢剂空间设置有除垢剂进液口、以及除垢剂出液口，本体出液管的进液端与除垢剂出液口连通，本体出液管的出液端用于与电子座便器的管道进液端连通，本体进液管的进液端用于与外部供水系统连通，本体进液管的出液端在电子座便器的控制器的信号控制下与除垢剂进液口连通或断开。本发明解决电子座便器内部功能模块由于水垢的集聚被堵塞而失效的问题，延长部件使用寿命。