一种隐形的沉降观测点系统及其施工方法，包括控制装置、线管、激光发射装置、塔尺和水准仪；控制装置、线管和激光发射装置均安装在幕墙内侧的主体结构上；激光发射装置安装在设计激光发射点的位置处，控制装置安装在主体结构内侧面上；线管连接在控制装置与激光发射装置之间，由控制装置控制激光发射装置激光的发射；在幕墙上、对应激光发射装置的位置处开设有洞口，激光发射装置发射的激光通过洞口射向幕墙外；在洞口上安装有视窗盖板；塔尺设置在幕墙的外侧，对应洞口位置处；水准仪架设在幕墙外侧的地面上、靠近幕墙的位置处。本发明解决了传统的施工方法影响建筑物外观美观、存在操作困难以及不能如实反映建筑物的沉降的技术问题。