本申请提供一种时钟漂移的消除方法及其装置，该方法：故障录波装置接收数字化变电站中至少两个合并单元发送的采样报文，至少两个合并单元包括第一和第二合并单元；故障录波装置判断其本地时钟与采样报文的时钟是否同步；当它们的时钟不同步时，故障录波器判断第一合并单元时钟和第二合并单元时钟是否同步；当第一和第二合并单元时钟不同步时，故障录波装置以其本地时钟为基准时钟，计算采样报文时钟与录波器时钟的偏差，得到第一平均时钟偏差；故障录波装置判断第一平均时钟偏差是否超出一个采样间隔时间；当其大于或等于一个采样间隔时间，故障录波装置根据第一平均时钟偏差进行采样点的拟合计算，以得到相比现有方法更精准的录波数据。