本发明提供了一种城轨列车再生制动能量吸收利用系统的控制方法，其特征在于：包括地面控制系统、地面逆变器、逆变器控制系统、车载控制系统、列车制动系统、能量分配系统、车载超级电容器和电容器控制系统；所述控制方法包括：（一）将制动信号发送给车载控制系统；（二）获取当前列车的发车时间间隔△t；（三）获取当前的有效再生制动反馈总能量；（四）对进行分配得到地面逆变器反馈能量和车载电容器反馈能量；（五）车载超级电容器对车载电容器反馈能量进行吸收；地面逆变器对地面逆变器反馈能量进行吸收。采用本发明所述的方法，有效延长列车车载超级电容器使用寿命，提高地面逆变器利用率，有效降低列车的使用、维护成本。