本发明涉及电力调度系统规划设计技术领域，具体涉及一种在水电、风电、光伏发电相互补偿运行方式下，基于电网结构和梯级水电站水力联系耦合的风光水互补发电计划计算方法。包括如下步骤：根据流域内风电、光伏和梯级水电站的电力送出通道，建立涵盖流域水电站、风电和光伏物理电站和电源集合的分层结构；在建立的电站和电源分层结构基础上，建立综合考虑流域内电站送出通道、水电站间水力联系的风光水互补调度模型；对以上模型按照分层协调方法进行求解，满足面向电网运行的梯级水电站与流域风电、光伏电源互补发电运行和计划制定需求。