本发明提出了一种基于WAMS的发电机励磁系统在线综合评价方法及系统，其中，该方法包括以下步骤：建立发电机励磁系统的指标体系；根据WAMS系统数据获取发电机励磁系统的静态指标和动态指标；对静态指标和动态指标进行归一化处理，并根据指标体系通过主客观决策分别获取励磁系统的主观权重与客观权重；以及根据主观权重和客观权重通过最小二乘法得到励磁系统的综合权重，并根据综合权重评估机组的运行评价。该方法使得评价结果更加合理，更加直观得体现了各机组之间励磁系统表现的差异，从而有利于提升电网对励磁系统的管理能力，提升网源协调水平。