本发明提供一种低负荷安全节能的脱硫方法及系统，该方法为：气体浓度测量器测量脱硫塔出口的SO2浓度。DCS基于SO2浓度，以及由压力变送器测量的第二循环泵输送浆液的压力，生成第一控制信号发送给第一循环泵，以及生成第二控制信号发送给变频器。第一循环泵基于第一控制信号确定开关状态。变频器基于第二控制信号控制第二循环泵的运行频率，以控制第二循环泵输送浆液的流量，调节第二浆液喷嘴的浆液喷淋量。在本方案中，通过采集脱硫塔出口的SO2浓度和第二循环泵输送浆液的压力，结合预先设置的控制参数控制第一循环泵的运行状态和至少两个第二循环泵的运行频率，从而调节浆液喷嘴的浆液喷淋量，将SO2浓度控制在预设范围，有效节约能源和提高脱硫系统的安全性。