本发明提供一种基于数据库的多关系数据轨迹追溯系统和方法，设定轨迹聚类，所述轨迹聚类设定特征信息；配置采样层级，根据特征信息进行数据采样，获得采样数据；令采样数据传入数据库，令数据库对采样数据根据特征信息进行数据分解，得到单元数据，计算相邻轨迹聚类包含的单元数据之间的多关系特征，得到数据库分析结果；匹配数据分析结果中相邻轨迹聚类的单元数据之间的多关系特征，绘制有方向的关系连接线。在外部容器中动态设定要追溯的不固定层次，不固定个数的数据区域，使用HTML5绘制连接线，表示数据之间的关系，反应数据上下游路径信息；使用数据库技术对大数据量数据进行快速分析，提高执行速度。