本发明提供了一种基于中速磁浮线路通过能力的供电分区优化设置方法，包括：确定中速磁浮线路上的区间个数、区间长度和最大定子段个数；利用遗传算法生成供电分区设置方案；利用能力计算模型计算每种供电分区设置方案下的线路通过能力；利用拉格朗日松弛算法对每种供电分区设置方案下的线路通过能力进行优化更新迭代，判断将通过能力最大的供电分区设置方案作为供电分区方案。本发明通过分析供电分区对中速磁浮线路通过能力的影响，构建基于中速磁浮线路通过能力的供电分区优化设置方法，解决了以提高线路通过能力为目标的供电分区优化设置问题，提高了中速磁浮线路上供电分区的适应性。