本发明提供了一种煤层气水平井洞穴砂埋修井工艺，该工艺包括：原井内依序下入防护套管、捞砂笔尖、尾管、捞砂泵和油管，开启所述捞砂泵以使对所述原井内的压裂砂进行清理，下入第一通井规通至洞穴顶部；取出第一通井规，下入衬管、丢手和油管，并记录所述衬管初始位置，取出油管，下入三牙轮钻头、螺杆钻和油管，并将三牙轮钻头下深至割缝衬管初始位置的底部；通过控制三牙轮钻头和螺杆钻进行钻井操作，直至所述三牙轮钻头钻进至人工井底；下入第二通井规通井至人工井底，并下入冲砂笔尖和油管至人工井底进行冲洗。本发明通过在割缝衬管内螺杆钻辅助钻进修井操作，保障了井筒完整性，有效的防止了砂埋修井过程中煤层垮塌现象的发生。