本发明提供一种红葱总蒽醌的制备方法及其应用，该制备方法包括：(1)取红葱干燥的上部分或鳞茎，提取过滤，得到浓缩液；(2)按浓缩液与水的体积比为(0.5‑3)：1混合，加热至30‑50℃，溶解得处理液，继续加热至60‑75℃，用大孔吸附树脂吸附，洗脱至洗脱液无色，用50‑95％的乙醇洗脱至洗脱液不含总蒽醌成分；(3)减压回收乙醇，剩余提取液浓缩上样至色谱柱，用25～30％和45～50％甲醇水溶液洗脱至洗脱液无色，用100％甲醇溶液洗脱，用纯丙酮洗脱，收集甲醇和丙酮洗脱液，干燥，得红葱总蒽醌。该制备方法操作简单、提取纯度高、提取效果稳定，将红葱总蒽醌运用于抗菌和舒张血管的治疗药物中，副作用小、不良反应发生率低，且疗效确切，可长期服用。