本申请提供一种业务报文处理方法及系统。一种业务报文处理方法，应用于集中控制框式设备，所述集中控制框式设备包括主控板卡以及至少一个安全业务板卡，所述主控板卡上存在主控CPU，所述安全业务板卡上存在独立CPU，所述主控板卡与所述安全业务板卡基于背板进行连接，所述方法包括：安全业务板卡按照预设的检测周期，检测安全业务板卡上业务报文上报独立CPU的端口的状态；若检测到安全业务板卡上业务报文上报独立CPU的端口的状态为DOWN状态，安全业务板卡则将所接收的业务报文上报至主控板卡上主控CPU；主控板卡上主控CPU接收所述业务报文，对所述业务报文进行相应业务处理。