本发明公开了一种防分段断路器死区故障母差保护闭锁备自投保护方法，解决现有技术无论是Ⅰ段母线故障还是Ⅱ段母线故障，均闭锁了备自投，即没有采用对应闭锁方案，容易造成全站全部停电的技术问题。本发明采用变电所110kV母差保护闭锁备自投的方案能够在各种运行方式下、各110kV母线故障时均能够正确动作闭锁备自投动作合闸，防止备自投误自投到故障设备上，有利于电网安全稳定运行。在分段(母联)死区故障时，110kV母差保护能够准确动作，切除故障。本发明采用变电所110kV母差保护闭锁备自投的方案能够在各种运行方式下110kV出线故障时，能够不误闭锁备自投动作合闸，提高了电网供电可靠性。