本发明涉及光学微波光子滤波芯片、微波频率测量系统及方法。通过在一片具有电光效应的基片表面设置两条互相平行、宽度相等但长度不相等的第一直波导和第二直波导；在基片的末端端面制作反射膜，在基片的输入端面进行抛光处理，即形成一种由两个微波光子滤波器组成的集成光学微波光子滤波芯片。以该微波光子滤波芯片为核心器件建立微波频率测量系统，通过调整电光强度调制器的偏置电压，使其工作在载波抑制状态，且使载波处在两微波光子滤波器的最大传输点，即可通过检测两滤波器的输出光功率的比值获得被测微波频率。微波光子滤波芯片具有结构简单、体积小、集成度高等优点，微波频率测量系统具有测量范围宽、实现容易、实用性强等特点。