本发明公开了一种基于图论的线损分摊方法，包括确定系统的节点数目、支路数目、发电机及负荷的数目以及整个系统功率的流向；根据各条支路的功率流向列出节点‑支路关联矩阵、节点输出功率关联矩阵；形成负荷发电机汲取因子矩阵A；形成发电机功率贡献因子矩阵B；形成负荷贡献因子矩阵C及负荷汲取因子矩阵D。计算发电机对线路功率的贡献因子矩阵KlG及发电机对负荷功率的贡献因子矩阵KLG；计算负荷对线路功率的汲取因子矩阵KlL及负荷对发电机功率的汲取因子矩阵KGL；通过KlG确定发电机侧线损分摊比例；通过KlL确定负荷对于线路线损的分摊比例。本发明能够根据贡献因子矩阵与汲取因子矩阵精确的得到线路和负荷的功率构成，合理的将线损分摊至发电机侧及对应的负荷侧。