本发明提供了一种生物反应装置，包括盖体、容器本体、密封部、驱动部和导液部。所述盖体设置的通气结构和阻菌密封透气结构使所述生物反应装置内外气压一致，清洗进液部贯穿驱动部的底部，所述导液部的进液部和出液部贯穿容器本体的侧壁设置，简化了结构；所述驱动部通过弹性形变驱动待置换液体或清洗液体进行升降运动，使得待置换液体通过所述气液通道才能够进入所述容器本体内，有利于后续通过对所述驱动部进行速率控制的方式避免载体承受剪切力而破坏肝细胞并使所述待置换液体形成扰流，以与所述载体进行充分接触。本发明还提供了生物反应系统。