本发明公开了黑胫病菌效应因子在诱导本氏烟叶片坏死中的应用，通过设计引物；烟草黑胫病菌基因组DNA的提取；PCR扩增烟草黑胫病菌效应因子基因；PCR产物的回收纯化；大肠杆菌DH5α感受态的制备；扩增产物连接pMDTM 19－T Vector并转化大肠杆菌DH5α；转化大肠杆菌；阳性克隆子筛选及菌液的PCR鉴定；筛选到的阳性克隆子进行测序鉴定，最终得到黑胫病菌效应因子。本发明的有益效果是克隆了烟草黑胫病菌的效应因子并分析其功能。