本发明公开了一种自动流转的全自动故障指示器流水线检测系统及方法，包括：故障指示器检测流水线包括：故障指示器采集单元检测流水线体和故障指示器汇集单元检测流水线体；智能仓储系统，用于实现故障指示器的自动存储、运输及管控；所述智能仓储系统包括：自动化立体仓库货架、AGV运载小车；所述AGV运载小车自动从自动化立体仓库货架上取出待检测故障指示器并运送至故障指示器检测流水线；同时，自动将检测完成的故障指示器运回自动化立体仓库货架并存储。本发明有益效果：能够满足国网运检部对故障指示器到货全检的要求，为落实国家电网公司关于加强配电网建设管理的系列部署，全面启动“一流配电网”建设管理工作，切实提高配电网发展质量和效率效益提供坚强支撑。