本发明涉及电路保护的技术领域，更具体地，涉及一种配电线路零序保护方向自适应判别方法，配电线路投运带上负荷时，投入CT极性自动检测功能，比较三相CT相电流Ip与相电压Up的相位差，与人工设定的负荷电流方向进行比较并判断CT极性，若CT极性接反，自动将三相CT极性取反，线路投运后退出CT极性自动检测功能及负荷电流方向；当线路发生接地故障时，比较自产3U0和3I0相位差，并根据相位差进行零序保护方向判别。本发明能够避免自产零序电流二次值太小造成零序电流测量精度不足的问题，零序保护方向判别采用自产零序电流和自产零序电压，且三相CT在带负荷时已经验证了极性，有效避免零序CT极性接反造成拒动的风险。