本发明公开了一种适用于热轧钢卷双运输线的运输系统的钢卷抽芯齐平系统，包括设置在热轧钢卷双运输线的运输系统上的钢卷抽芯齐平装置、检测装置和PLC控制系统，所述钢卷抽芯齐平装置和检测装置分别与PLC控制系统通讯连接，所述钢卷抽芯齐平装置对发生抽芯现象的钢卷进行拍齐处理，所述检测装置设置在钢卷抽芯齐平装置的上游，且用于检测钢卷的抽芯量是否达到需要进行拍齐处理的设定值。本发明效率高，不易损坏钢卷的外形质量，噪音小，降低了装置的运行成本，能够紧跟国家倡导的清洁化工厂和绿色工厂的要求，不易卡死，自动化程度高。