本发明公开了一种抛石海床地基钢管桩基础处理方法，包括以下步骤：(1)利用浮船式打桩机在沙桩设计位置的海床上打入多根沙桩，在全部沙桩顶面做抛石地基处理并整平，在抛石地基之上安装预制钢筋砼沉箱；(2)在所述的预制钢筋砼沉箱上且在连接首跨贝雷梁左梁端左侧进行桥台施工；(3)安装首跨贝雷梁及桥面结构；(4)起重机通过试打在预制钢筋砼沉箱右侧的抛石基床范围内试打三根钢管桩；(5)在试打三根钢管桩的外侧支设钢管桩；(6)进行受力体系转换。采用本方法，实现抛石地基影响管桩沉入时顺利跨越的目的。