为解决离子吸附型稀土矿山现有原位浸出工艺浸液渗漏、山体滑坡和生态破坏等问题，本发明公开了一种离子型稀土的渗流控制原位开采方法，该方法是在现有原位浸出工艺中引入综合物探法进行基岩底板的断层、裂隙和破碎发育情况检测；在现有原位浸出工艺中引入注浆技术在发育不良的基岩底板构建防渗层，防止浸液通过基岩底板进入地下水造成稀土资源损失；在现有原位浸出工艺中引入由浸润线自动监测、自动注液和真空抽提构成的注提自控系统，实现浸液注入‑抽提的精准控制，助力数字化矿山的建设。本发明特别适合底板发育不良、渗透性较差的离子吸附型稀土矿山。