本发明提供了一种高硅铝比小晶粒NaY分子筛及其制备方法。其制备方法为：将固体硅源与聚合物混合后在氮气保护下高温处理得到高活性硅源；将硅源、铝源、碱液和水混合进行陈化得到导向剂；将高活性硅源、导向剂和水混合搅拌得到反应凝胶；将反应凝胶进行晶化，过滤洗涤干燥后得到高硅铝比小晶粒NaY分子筛。本发明提供的高硅铝比小晶粒NaY分子筛的制备方法能够在较短时间内直接制备出高硅铝比的Y型分子筛，与常规方法相比，在相同的投料摩尔比的条件下，能够明显缩短晶化时间，并提高产品的硅铝比，提高硅源利用率，反应凝胶中硅源、铝源的固含量高，进而，单釜收率比目前工业使用水玻璃的产率提高一倍及以上。