本发明公开了一种基于北斗亚纳秒级高精度授时的编译器检测装置及方法，通过发包程序发送指定格式的数据包；开发板在有数据包通过时执行加载的被测代码；信号时戳生成器对通过开发板前和通过之后的指定格式的数据包进行标记，生成标记有亚纳秒级时间戳的数据包；收包程序对接收的标记有亚纳秒级时间戳的数据包进行时间差计算，获得延时数据；延时数据处理程序根据延时数据，对编译器的配置情况进行检测。本发明可以实现简化对编译器检测的流程，提供了一种较为方便的检测方式，并且提高了检测效率。