本发明公开了一种基于CT可视化和3D打印的岩样制备方法，包括对岩石样品进行初始状态的CT扫描实验；对初始状态CT扫描得到的二维图像进行降噪、二值化和分割处理；对处理后的图像通过设定算法或软件建立岩石样品3D数模；将岩石样品孔裂隙作为实体结构，并利用分水岭算法将孔裂隙模型单独提取；对初始状态的孔裂隙模型进行平滑处理，并将3D数模输出格式设定为.stl；以及将输出为.stl格式的孔裂隙模型导入到3D打印机中，并选取与岩样性质相近的透明材料进行3D打印，以获得透明的3D数模。本发明的有益效果是，模拟式样制作效率高，模拟试样性质与岩石试样性质接近，且多个模拟试样一致性好。