本发明公开了一种分块式多波段滤镜的掩膜板成像系统。包括掩膜板相机和分块式多波段滤镜，所述的掩膜板相机为由掩膜板和光电传感器阵列组成的无透镜相机，光电传感器阵列是有多个光电传感器紧密阵列排布而成，掩膜板置于光电传感器阵列的探测面前方，光电传感器阵列的探测面布置有分块式滤镜；分块式多波段滤镜采用滤光片分块式布置，每个波段对应的滤光片连续排列。本发明提高了掩膜板相机的多波段成像质量，简化了多波段滤镜加工工艺，为掩膜板相机多波段成像奠定基础。