本发明公开了一种提高西南烟区烟田水肥利用效率和土壤质量的方法。包括：在烤烟移栽前，对耕作层土壤进行深耕、碎垡、平整；在同一地块内，按照预设置的固定方向，刨出宽80‑100cm的、深度达到耕作层底部的凹形浅平沟，两凹形浅平沟中心线之间的距离为120cm，相邻两凹形浅平沟相邻边之间的距离为20‑40cm；将细短作物秸秆铺垫在凹形浅平沟的底部，铺垫的厚度在5～10cm，在铺垫过程中避免混入土壤；将挖掘凹形浅平沟时所刨出的土壤覆盖到铺垫的细短作物秸秆上以形成垄；在形成的垄上种植烤烟；烤烟采收完成后，将垄体耙平，并将垄底腐烂的细短作物秸秆与耕作层土壤充分混合均匀。应用本发明，可提高烟田水肥利用效率、改良西南烟区土壤。