本发明属于计算机技术领域，特别涉及一种基于加密运算的集群化加速计算方法及系统，所述加速计算方法包括：接收加密计算任务，查询集群资源列表，其中，所述集群资源列表包括CPU资源使用率、内存资源使用率；根据所述集群资源列表，选择最优集群节点，发送所述加密计算任务到所述最优集群节点；所述最优集群节点接收并使用第一计算单元和/或第二计算单元执行所述加密计算任务，返回任务计算结果。本发明采用具有负载均衡策略的计算集群，提高任务计算速度和效率，适合RSA2048、ECC等主流非对称加密算法的加解密计算、共享密钥计算。