一种多孔聚醚醚酮颅骨替代物及其制造方法，颅骨替代物的边缘轮廓与自体颅骨缺损部位良好吻合，颅骨替代物包括主体实体及多孔结构，主体实体为弧形多孔结构，并加有实体加强筋，实体加强筋通过拓扑优化获得；多孔结构包含编织结构、通孔、编织结构和通孔的复合，颅骨替代物边缘轮廓有螺纹孔结构，便于其安装固定；制造方法采用熔融沉积成型、选择性激光烧结技术的加工方法制备，通过对多孔结构的后处理，可提高多孔聚醚醚酮颅骨替代物的力学性能和生物活性，使替代物周围的组织长入替代物，实现生物固定；本发明多孔聚醚醚酮颅骨替代物植入体内后能够与自体颅骨缺损部位良好吻合，便于安装固定，实现颅骨替代物轻量化设计以及替代物的异物感减弱。