本发明提供了一种仿自然生态鱼道及其施工方法，其中，所述仿自然生态鱼道结构为：其横断面为梯形，由下至上依次铺设第二复合土工膜(5)、细砂层(4)、第一复合土工膜(3)、砂料级配碎石过渡层(2)和宾格网石笼底坡(1)；在所述宾格网石笼底坡(1)上沿仿自然生态鱼道延伸方向间隔设置若干浆砌石隔墙(6)。与传统鱼道相比，本发明仿自然鱼道最大化地构建出与水利工程建造前鱼类天然洄游通道近似的环境，尽可能使用当地的天然建筑材料，更加贴近自然条件，因而具有更好的过鱼效果。