本发明公开了一种脉冲电场协同纤维素酶提取柚皮果胶的方法。该方法包括：将柚皮清洗切块，进行灭酶处理，浸泡在水中进行加热，以除去可溶性杂质和色素，洗涤，过滤，烘干，粉碎过筛，得到柚皮干粉；将柚皮干粉加入水中，混合均匀，得到分散液，调节分散液的pH为酸性，然后进行脉冲电场处理，得到处理液；将纤维素酶加入处理液中，然后加热进行酶解处理，得到酶解液；将酶解液抽滤，取滤液，然后旋转蒸发浓缩，醇沉，过滤取滤渣，漂洗滤渣，干燥处理，研磨得到所述柚皮果胶。本发明提供的柚皮果胶提取方法简单，先用脉冲电场破坏植物细胞壁，增加果胶溶出，再用纤维素酶酶解细胞壁中的纤维素，有利于促进果胶的提取和溶出。