本公开提出了一种主动配电系统动态分区及储能设备优化配置方法及系统，以电压灵敏度因子为基础定义节点之间的距离；基于上述距离利用基于峰值密度的快速聚类算法给出主动配电系统的动态分区信息，求取一定时期的三相分区并集和分区并集中各分区节点的计及度、紧密度以及介数的节点重要性指标以获得储能设备配置的个数和地点；定义目标函数和约束条件获取储能设备的最优容量。使用改进的基于峰值密度的快速聚类算法求解主动配电系统动态分区信息，使得分区可以适应系统运行方式变化，基于分区信息对储能设备进行配置，能够保证系统在各运行方式下各分区内均有充足的调节资源。