本发明为污水处理领域，具体涉及抗生素废水的处理工艺，还涉及上述的废水处理工艺中所用的系统。本发明的工艺包括以下的步骤：(1)通过蠕动泵将抗生素废水从进水槽泵至上流式厌氧复合床反应器中进行厌氧处理；(2)将(1)中经厌氧处理后的水输送至电化学反应器中继续处理，然后通过第二出水口排放出。本发明的有益效果：采用本发明的方法及系统对抗生素废水进行处理，缩短了抗生素废水的处理周期；耗电量少，节约了成本；系统运行稳定，对CO D cr和氨氮的去除率均保持在一定的区间范围；对CO D cr和氨氮的去除率达90％以上，处理效果良好。