本发明涉及一种消除底抽巷穿层钻孔预抽煤层空白带的钻孔设计方法，属于井下瓦斯抽采技术领域，包括以下步骤：A.划定预抽范围的边界线，确定底抽巷内穿层钻孔的开孔位置P；B.确定边界钻孔轴线PA0和PB0；C.确定第一钻孔轴线，将边界钻孔轴线向预抽范围的中心偏移距离为抽采半径R得到第一偏移线，以第一偏移线与煤层顶板线的交点为圆心且以R为半径得到第一圆，取第一圆与煤层顶板线的内交点与点P连接得到第一钻孔轴线PA1和PB1；D.确定第二钻孔轴线PA2和/或PB2；E.确定第n钻孔轴线PAn和/或PBn，直至AnBn的距离小于抽采直径；F.以PAn、PBn为中心且以R为半径钻孔。本装置解决了现有技术中底抽巷穿层钻孔在预抽煤层布置存在空白带和重复率高的问题。