本申请所提供的一种基于聚类及光流法的高光谱和LiDar图像自动化配准方法，包括：选取高光谱图像中的目标波段，并基于目标波段构建伪彩色图像；对LiDar图像进行预处理，得到二维栅格化图像；利用PCA算法对伪彩色图像和二维栅格化图像进行降维并提取主成分处理，分别得到第一数据集合和第二数据集合；利用K‑means聚类算法确定第一数据集合和第二数据集合中对应区域的种子点，并进行图像粗配准操作，得到初始配准图像；利用光流法对初始配准图像进行精配准，得到配准图像。本申请将PCA算法与K‑means聚类算法相结合，实现自动提取配准种子点，提高了配准效率，且利用光流法进行精配准，提高了配准精度。