本申请公开了一种用于粪便研究的粪便样本处理方法及装置，所述方法包括收集粪便于垫有草纸的折叠防水纸盒中；用一次性压舌板快速挖取粪便到数个冻存管中；将耐低温标签贴在装有粪便的冻存管上，得到粪便样本；将所述粪便样本放置于保温装置中进行转运。本申请更适合大面积推广使用，尤其是在进行大面积体检并收集粪便样本时使用。首先是操作简单容易被受试者理解并接受，留取粪便在自家进行很好的保护受试者隐私并且节省专业人员的人力和物力。其次是利用低温保护的原理很好的保证粪便样本的质量，不使用保护剂，保留样本的原始特点，使样本的使用途径不受限制，可以更好的开发利用样本。