本发明提供了坐标转换方法及激光显微切割方法，坐标转换方法包括以下步骤：(A1)建立屏幕坐标系和现实坐标系；(A2)在屏幕坐标系中选取若干点位，通过点位之间的连线，将屏幕分为至少二个区域；(A3)所述移动件移动，使得成像在屏幕坐标系中的移动件分别处于所述点位处，分别获得各区域的且与所述移动件对应的屏幕坐标和现实坐标；(A4)根据与移动件对应的屏幕坐标和现实坐标以及数学模型获得表达式；(A5)求解上述表达式，获得平移矩阵T以及四元数旋转矩阵R，从而实现了屏幕坐标和现实坐标间的转换。本发明具有转换精确等优点。