本发明涉及一种直流配电网网络化保护系统，将直流配电网分为至少一个母线区域和至少一个联络线区域，每个母线区域均划分为至少一个母线间隔，每个联络线区域均划分为至少一个联络线间隔，在各母线间隔和各联络线间隔中分别设置母线间隔就地保护单元和联络线间隔就地保护单元，各母线间隔就地保护单元与各母线间隔一一对应，各联络线间隔就地保护单元与各联络线间隔一一对应。各区域配置不同原理和逻辑的保护功能，使得不同类型区域内的各保护单元能够结合本区域内其他间隔保护单元的故障信息准确定位故障，提高了直流配电网保护的选择性及其供电的可靠性。