本发明公开一种低表面能水性环氧防腐涂料及其制备与应用。该涂料分子结构中含有环氧基、聚醚、硅氟、石墨烯等结构；在其乳化环氧树脂阶段，自乳化水性环氧固化剂使其具有优异的水性和较强的乳化能力，与环氧树脂具有较好的相容性，提高了乳液的稳定性。在改性氧化石墨烯改性涂料固化阶段，保证自乳化水性环氧固化剂在涂层中不析出，形成稳定的涂层；柔性长链聚醚在涂层中形成柔性微区，提高涂膜的力学性能；硅氟溶胶降低了涂膜表面能；石墨烯以化学键接枝到分子结构中，分散性能提高后，能够高效的覆盖在金属表面，提高涂层的防腐蚀性能。因此，本发明的涂料成膜后附着力、硬度、耐酸碱性、耐水性等性能优良，各成分相容性好、可用于金属部件等。