本发明提供一种直流电力电子变压器及其控制方法和装置，属于直流电力电子变压器技术领域。该控制方法针对Boost模块采用Boost电压环、Boost电流环和电压均衡环的控制策略；针对DC/DC变换模块采用DC/DC电压环和DC/DC电流环的控制策略；其中，计算高压直流母线电压测量值与所有处于投入状态的功率变换单元的Boost母线电压值之和的比值，得到初始控制量，将得到的初始控制量减去Boost电流环的输出值用于作为Boost模块的控制信号；DC/DC电流环的输出值和DC/DC变换模块的电压增益用于作为DC/DC变换模块的控制信号。本发明能提高控制系统的运行稳定性。