本发明公开了一种考虑弃水风险的跨流域水电站群调峰优化调度方法，包括以下步骤：S1、构建水电站群调峰优化调度模型；S2、计算各梯级水电站的弃水风险大小；S3、基于所述各电站的弃水风险协调分配各电站发电量；S4、基于所述各电站的电量分配计算所述水电站群调峰优化调度模型的最优解得到各电站出力过程线，完成水电站群联合调峰调度。通过径流频率来量化分析水电站弃水风险，并基于弃水风险值协调分配不同流域水电站群调峰电量，能够充分考虑各电站的弃水风险，发挥了不同流域水电站群的径流补偿及电力补偿效益，从而在电网水电系统调峰时大大降低了水电弃水风险，减小了水电弃水电量。