本发明提出一种肽段‑谱图匹配可信度检验方法、系统、存储介质及装置，包括：将待检测结果中图谱数据输入至开放式搜索引擎，得到待检测结果的鉴定结果；获取限定式搜索引擎对待检测结果的打分，得到第一分值，同时提取第一分值排前n名候选肽段；获取开放式搜索引擎对鉴定结果的打分，得到第二分值，同时提取第二分值排前n名候选肽段；预测每个候选肽段的理论谱图，计算每张理论谱图与待检测结果中图谱数据的余弦相似度，并统计余弦相似度中的最高值；提取由待检测结果的第一分值、第二分值、余弦相似度和最高余弦相似度值组成的四维特征；将四维特征输入至使用SVM训练的离线模型，得到待检测结果的可信度检验结果。