本发明公开了抽能电抗器保护技术领域的一种基于空心变压器参数的抽能电抗器匝间零差保护方法，旨在解决现有技术中抽能电抗器抽能绕组匝间故障检测灵敏度不高、存在保护元件拒动、误动的技术问题。采集主电抗首端零序电流和抽能绕组零序电流；计算零序差流和零序制动电流，零序差流计算通过基于空心变压器参数模型的一次电流折算系数将主电抗首端零序电流折算至抽能绕组侧；设置零序差动元件的动作条件和闭锁条件，当满足动作条件且无闭锁条件时，则判定发生区内匝间故障。本发明能够灵敏的反应主电抗绕组和抽能绕组匝间故障，同时能够有效防止零差保护元件误动，适用于多种工况，极大地提高抽能绕组保护的灵敏性及可靠性，同时零差保护元件无延时，动作速度快。