本发明属于海上防砂堤地基分层沉降监测装置领域，尤其涉及一种海上防砂堤地基分层沉降监测装置及其埋设方法，所述海上防砂堤地基分层沉降监测装置包括地下监测装置、地表监测装置及保护装置，所述保护装置包括沉降盘、网兜和护管，所述网兜内包裹块石，所述护管套在所述分层沉降管上，所述地表沉降磁环嵌套于护管之外，所述地表沉降磁环被所述沉降盘压住，所述地表沉降磁环在沉降盘之下，所述网兜在地表沉降磁环在沉降盘之上。本发明提供一种可以精确测量，既能满足对测量精度的要求，又能避免分层沉降管被抛石破坏，维护方便，经济实用的海上防砂堤地基分层沉降监测装置及其埋设方法。