本申请公开了一种芯片控制系统，包括第一控制装置和芯片底板，芯片底板包括开关矩阵、电源和一或多个测试位，各测试位包括芯片底座和系统电路，芯片底座包括第一管脚和第二管脚，第一管脚通过通信接口和第一控制装置相连，第二管脚通过开关矩阵和电源相连，开关矩阵的控制端连接至第一控制装置；所述芯片底座用于将所放置的芯片与开关矩阵、系统电路和电源组成芯片电路，并将所放置的芯片与所述第一控制装置连通；所述第一控制装置用于控制所述开关矩阵中的各个开关断开或闭合，并控制所述芯片底座上的芯片。本申请通过第一控制装置替代ATE，降低了芯片控制的成本，提高了芯片控制的效率。