本发明公开了一种催化裂化柴油加氢异构‑流化催化裂解的方法，包括如下步骤：1)将催化裂化柴油与氢气混合，进入一段串联的加氢反应装置，所述的加氢反应装置内依次装填加氢保护剂、加氢精制催化剂、加氢异构催化剂，进行加氢精制‑加氢异构反应；2)加氢异构柴油进入一个流化床催化裂解装置，进行催化裂解反应。本发明方法利用催化裂化柴油生产低碳烯烃和清洁燃料油品，该方法能在催化裂化柴油全转化条件下，产物中低碳烯烃含量>35wt％，汽油馏分中芳烃含量>50wt％，可显著提升催化裂化柴油价值。