本发明公开了一种超大规模电池储能电站运行单元检测的方法及系统，其中方法包括：采集储能电池正常运行状态下电池容量衰减过程中的放电数据，将放电数据作为参考历史数据；采集储能总系统、储能子系统以及储能子系统所包含的储能单元的运行状态参数数据；构建储能总系统、储能子系统以及储能单元之间重要性的分析模型；分析储能子系统与储能总系统的相关程度，确定每个储能子系统的重要性因数；分析储能单元与储能子系统的相关程度，确定每个储能单元的重要性因数；分别选取出储能子系统与储能单元的重要性因数大于预设阈值的储能子系统与储能单元，分析储能子系统和储能单元的运行状态参数数据与参考历史数据的偏差。