本发明公开了一种电化学储能系统主动均衡电路及均衡控制方法，该均衡电路包括两个以上电池单体串联构成的电池串、均衡臂、均衡母线、储能元件，均衡臂包括上均衡臂和下均衡臂，均衡母线包括正均衡母线和负均衡母线，每个电池单体的正极通过上均衡臂连接至正均衡母线，电池单体的负极通过下均衡臂连接至负均衡母线，正均衡母线和负均衡母线之间通过储能元件连接。通过控制均衡臂的导通状态和导通时序，可以使单体电压较高的一个或多个相连的电池单体通过均衡臂及均衡母线将能量传递给储能元件，储能元件再将能量经由均衡母线及均衡臂将能量传递给单体电压较低的一个或多个相连的电池单体。该电路拓扑结构简单、有效，不仅成本低，而且可靠性高。