本发明公开了一种具有自清洗功能的蒸发式冷凝器系统及控制方法，所述系统包括换热器、通过管路串联在一起的储水箱、喷淋水泵和雾化喷淋支路，所述雾化喷淋支路正对换热器且能够喷射水雾，所述雾化喷淋支路并联有一清洗喷淋支路，所述清洗喷淋支路包括连接管Ⅰ、清洗喷嘴和电磁阀Ⅰ,所述清洗喷嘴有多个,清洗喷嘴及电磁阀Ⅰ安装在所述连接管Ⅰ上,所述连接管Ⅰ两端所述管路连接；所述方法包括对雾化喷淋模式及自清洗模式的控制，本发明能够有效的避免水垢的凝结及灰尘的附着，能够保证冷凝器正常工作，同时，通过该控制方法来实现避免结垢及灰尘粘附的目的。