本发明涉及一种基于PMU数据对配电网线路进行故障选线的方法，通过结合总体平均经验模式分解方法进行高频能量计算，根据PMU数据的特点设计完整的数据提取使用流程和故障选线系统。包括本地子站以“子站‑主站”协同架构上传故障时的高频数据；根据高频数据计算所有馈线平均电流幅值差；根据PMU自带的故障录波器提供的故障录波数据做EEMD变换计算所有线路的高频暂态能量；计算所有线路的故障可信度；根据故障可信度确定最终的故障馈线。本发明实现配电网线路故障在线选线，具有自适应分解的优势，消除传统模态分解方法所带来的模态混叠效应，适用于所有故障类型地选线方法，选线结果更加精准，定量的故障可信度更加直观明了。